El centro de Investigación del Agua (CIAGUA) Realiza investigaciones en Hidráulica, Hidrología e Ingeniería Sanitaria.
Este centro se creó en marzo del 2016, realiza trabajos de investigación con recursos de la UAJMS en convenio con el Ministerio de Medio Ambiente y Agua (MMAA). Realiza trabajos en:
Para la realización de estos trabajos cuenta con el equipamiento necesario, entre los que se cuenta, los medidores acústicos de efecto Doppler.
Realiza investigación no solo en el departamento de Tarija, sino que ha ampliado su campo de acción a los departamentos de Chuquisaca, Potosí y Cochabamba, mostrando una gran capacidad de gestión.